抗体一级结构的准确解析在药物研发、功能研究与质量控制中具有重要意义。液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术凭借其高灵敏度、宽动态范围和对翻译后修饰的识别能力，已成为抗体肽段测序的关键工具，为抗体结构分析提供高通量、可重复的解决方案。

一、LC-MS/MS在抗体肽段测序中的技术流程概述

抗体测序通过质谱手段对蛋白质进行酶解、分离、碎裂及数据分析，获得氨基酸序列信息。主要步骤包括：

• 酶解处理：将抗体切割为适宜分析的小肽段，增强质谱解析覆盖率；
• 色谱分离：通过液相色谱对肽段混合物进行梯度分离，减少信号干扰；
• 串联质谱分析：在MS/MS模式下获取肽段碎片离子信息，用于序列反推；
• 数据解析：结合数据库比对与去新测序（de novo）方法完成序列重构。

整个流程无需已知序列背景，适用于广泛来源和结构类型的抗体样本。

二、LC-MS/MS在抗体测序中的技术优势

1、高序列覆盖率

LC-MS/MS可实现对抗体重链与轻链的高覆盖率测定，尤其对高变区（CDR）区域具备较强解析能力，有助于揭示关键结构差异。

2、翻译后修饰识别能力强

质谱技术可精确检测诸如氧化、去酰化、糖基化等翻译后修饰，提升对抗体功能状态与稳定性的理解。

3、支持未知抗体的去新测序

无需参考序列即可实现从头拼接，适用于序列未公开或来源不明的抗体样本，拓宽抗体结构研究范围。

4、适用于一致性评估与变异检测

通过质谱图谱比对可检测抗体批次之间的结构差异、修饰偏移或表达体系引起的变化，增强工艺可控性。

5、灵活适配多类型抗体结构

LC-MS/MS适用于各类抗体形式，包括全长抗体、抗体片段及构建体复杂的工程抗体，具备良好通用性。

三、LC-MS/MS在抗体研发中的应用场景

LC-MS/MS在抗体药物开发的多个阶段均有广泛应用，涵盖从筛选到质量管理的各个关键环节：

• 序列确认：用于验证表达抗体是否与预期序列一致，防止突变引入；
• 结构比对：比较不同样本中抗体结构的一致性，用于稳定性评估；
• 变异与修饰监测：识别轻微的氨基酸替换及PTMs，确保功能不受影响；
• 去新测序应用：对缺乏公开信息的抗体分子进行结构拼接，适用于基础研究和差异化研发；
• 质量控制支持：为生产工艺放大与药品申报提供分子层面的结构依据。

LC-MS/MS具备的高分辨率与可重复性，使其成为抗体结构分析的重要技术路径。

LC-MS/MS作为抗体肽段测序的核心技术手段，已在抗体研究与开发的多个环节中发挥关键作用。其在序列解析、修饰识别、一致性评价等方面的综合优势，使其成为当前抗体结构表征的重要平台。在抗体药物日益复杂、结构要求日益严格的背景下，选择具备专业技术能力与高质量交付标准的服务团队，是保障项目进展与数据合规的关键。百泰派克生物科技专注于高分辨率质谱分析，期待为您的抗体研发项目提供可靠的数据支持与技术保障。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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