在质谱技术主导蛋白质组学的时代，Edman降解似乎成了“过去式”。但事实并非如此。作为一种经典且精准的N端蛋白质测序方法，Edman降解在多个关键场景中依然有着不可替代的价值，尤其是在蛋白质结构验证、药物质量控制以及非模式生物的研究中。本文将深入解析Edman降解的原理与优势，剖析其在现代科研与生物医药中的独特应用场景，并探讨如何与质谱技术形成互补，发挥最大效能。

一、什么是Edman降解？

Edman降解是一种用于确定蛋白质或多肽N端氨基酸序列的化学方法，由瑞典生物化学家Pehr Edman于1950年开发。其基本原理包括三步：

1、N端氨基酸与苯异硫氰酸（PITC）反应；

2、形成环状衍生物并在酸性条件下断裂，释放出首个氨基酸（以PTH衍生物形式）；

3、使用HPLC对PTH-氨基酸进行鉴定。

💡这种逐步“读取”N端序列的方式，最多可测定约30个氨基酸，在高纯度样品中具有极高的准确率。

二、为什么Edman降解仍然不可或缺？

尽管质谱具有高通量和高灵敏度等优势，但在以下几个关键应用中，Edman降解仍展现出其他方法难以替代的独特价值：

1、N端验证：确保蛋白翻译起始位点准确

在表达与纯化蛋白质时，科学家常常需要确认是否从正确的起始密码子开始翻译，是否存在N端延伸或截断。这在设计功能蛋白、重组抗体、疫苗时尤为关键。

• 质谱在识别复杂翻译后修饰或N端微小变化时可能受限；
• 而Edman降解能直接读取N端序列本身，无需依赖数据库，结论更具确定性。

💡典型应用：确认抗体重链/轻链是否有额外的起始氨基酸，判断表达系统中信号肽是否被准确切除。

2、蛋白药物研发与生产：构建稳定可靠的质量体系

在生物药开发过程中，蛋白质结构一致性是质量控制的核心环节。无论是药物发现阶段的初始筛选，还是后期的中试放大与生产批次稳定性评估，N端测序都是重要的验证手段。

• Edman降解可用于确认蛋白质起始序列是否符合设计；
• 帮助研发人员判断表达系统是否导致非预期的氨基酸修饰或切除。

3、凝胶条带鉴定：验证目标蛋白身份，排查杂带干扰

在SDS-PAGE或2D凝胶中，即使某条蛋白条带看似纯净，其真实组成仍可能包含多种蛋白。直接将条带切下并进行Edman测序，可以快速判断其主成分是否为目标蛋白。

• 不同于质谱常见的“混合肽段分析”，Edman可线性读取蛋白N端序列，对单一主带蛋白尤为精准；
• 在抗原制备、蛋白纯度验证等实验中，提供直观可追溯的结构信息。

4、非模式生物研究：无需数据库，获取原始序列信息

质谱依赖数据库进行肽段匹配，而对于尚无完整基因组信息的非模式物种（如某些植物、微生物或海洋生物），这种方法存在明显局限。

• Edman降解则以化学方式直接读取N端序列，不依赖任何背景信息；
• 是非模式物种中新蛋白发现与初步结构鉴定的重要手段。

三、Edman降解的局限性及最佳应用策略

虽然Edman降解具有独特优势，但它也存在一些技术限制：

因此，科研和工业界更倾向于采用“Edman + 质谱”双策略：

• 用Edman降解精确定义蛋白质N端序列；
• 用质谱补足中段与C端序列，实现全序列确认。

Edman降解依然是蛋白质测序中最具确定性的一环，在对结果精度要求极高的场景下，它不仅是对质谱结果的重要补充，更是某些关键节点上的“唯一选择”。百泰派克生物科技致力于提供高质量的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服务，帮助科研与产业客户提升数据可信度，加快研发进程。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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