串联亲和纯化质谱（Tandem Affinity Purification-Mass Spectrometry, TAP-MS）是结合了蛋白质纯化和质谱分析的强大工具，广泛应用于细胞生物学、分子生物学及生物化学等领域。其核心理念是通过特异性亲和纯化步骤，结合质谱分析，识别和定量蛋白质以及蛋白质复合物。通过串联亲和纯化质谱，研究人员能够从复杂的生物样品中提取目标蛋白质，并对其进行高精度的定性和定量分析。在细胞生物学研究中，串联亲和纯化质谱被广泛用于研究蛋白质复合物的组装和动态变化。蛋白质复合物是细胞内功能执行的基本单位，其组成和结构的变化往往与细胞的状态和功能密切相关。通过TAP-MS技术，研究者能够在天然状态下捕获蛋白质复合物，并对其组成进行全面分析。此外，串联亲和纯化质谱在揭示信号传导途径中的蛋白质角色方面也发挥作用。细胞信号传导是通过一系列蛋白质相互作用和调控事件实现的，TAP-MS技术能够帮助研究人员识别关键的信号调控蛋白及其相互作用伙伴，从而深入理解信号传导机制及其在疾病中的异常变化。TAP-MS也被应用于疾病研究中。例如，在癌症研究中，利用TAP-MS技术可以揭示与肿瘤进展和转移相关的关键蛋白质及信号通路，有助于发现潜在的治疗靶点。

一、串联亲和纯化质谱的技术流程

1、样品制备

串联亲和纯化质谱的第一步是样品制备，其核心在于对目标蛋白质进行特异性标记，通常采用基因工程技术在目标蛋白质的N端或C端融合亲和标签。常用的标签包括蛋白A、FLAG标签等，这些标签能够与特定的亲和基质结合，为后续的纯化步骤奠定基础。

2、亲和纯化

样品制备完成后，进入亲和纯化阶段。通过特定的亲和基质（如抗体或蛋白A树脂），从复杂生物样品中捕获目标蛋白质及其结合的蛋白质复合物。纯化通常分为两步：首先通过第一亲和基质富集目标蛋白质，然后使用第二亲和基质进一步纯化，以提高纯度和特异性。

3、质谱分析

经过纯化的蛋白质样品通过酶切等方法处理后，进行质谱分析。质谱仪能够精确测量蛋白质的质量和丰度，从而实现蛋白质的鉴定和定量。通过质谱数据分析软件，可以识别蛋白质的序列信息并构建相应的蛋白质相互作用网络。

二、串联亲和纯化质谱的优势与局限性

1、优势

串联亲和纯化质谱的一个显著优势是其高特异性和高纯度。通过两步亲和纯化，TAP-MS能够有效去除非特异性结合蛋白质，提高目标蛋白质及其复合物的分析精度。此外，质谱分析的高灵敏度和高分辨率特性，使得串联亲和纯化质谱能够检测低丰度蛋白质和微量蛋白质相互作用，极大地拓展了蛋白质组学研究的深度和广度。

2、局限性

尽管串联亲和纯化质谱有诸多优势，但也存在一些局限性。亲和标签的引入可能影响目标蛋白质的天然结构和功能，从而影响其在细胞内的行为。另外，亲和纯化步骤复杂且时间较长，可能导致样品损失。并且质谱分析需要高水平的设备和技术支持，对实验室环境和人员技能有较高要求。

百泰派克生物科技致力于提供卓越的蛋白质相互作用质谱分析服务，帮助客户在蛋白质组学研究中取得突破。我们的专家团队拥有丰富的经验和深厚的专业知识，能够为客户提供从实验设计到数据分析的一站式服务。无论是在基础研究还是应用开发中，我们的蛋白质相互作用质谱分析服务都将助您一臂之力，揭示复杂的蛋白质相互作用，推动科学的进步与创新。欢迎与我们联系，共同探索蛋白质组学的无限可能。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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